Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CABP4P57796 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CABP4P57796 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CABP4P57796 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CABP4P57796 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CABP4P57796 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CABP4P57796 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CABP4P57796 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CABP4P57796 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CABP4P57796 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CABP4P57796 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CABP4P57796 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CABP4P57796 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CABP4P57796 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CABP4P57796 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CABP4P57796 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CABP4P57796 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CABP4P57796 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CABP4P57796 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CABP4P57796 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CABP4P57796 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CABP4P57796 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CABP4P57796 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CABP4P57796 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CABP4P57796 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CABP4P57796 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CABP4P57796 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CABP4P57796 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CABP4P57796 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CABP4P57796 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CABP4P57796 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CABP4P57796 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CABP4P57796 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CABP4P57796 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CABP4P57796 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CABP4P57796 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CABP4P57796 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CABP4P57796 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CABP4P57796 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CABP4P57796 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CABP4P57796 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CABP4P57796 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CABP4P57796 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CABP4P57796 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CABP4P57796 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CABP4P57796 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CABP4P57796 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CABP4P57796 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CABP4P57796 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CABP4P57796 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CABP4P57796 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CABP4P57796 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CABP4P57796 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CABP4P57796 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CABP4P57796 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CABP4P57796 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CABP4P57796 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CABP4P57796 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CABP4P57796 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CABP4P57796 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CABP4P57796 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CABP4P57796 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CABP4P57796 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CABP4P57796 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CABP4P57796 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CABP4P57796 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CABP4P57796 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CABP4P57796 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CABP4P57796 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CABP4P57796 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CABP4P57796 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CABP4P57796 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CABP4P57796 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CABP4P57796 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CABP4P57796 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CABP4P57796 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CABP4P57796 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CABP4P57796 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CABP4P57796 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CABP4P57796 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CABP4P57796 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CABP4P57796 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CABP4P57796 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CABP4P57796 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CABP4P57796 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CABP4P57796 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CABP4P57796 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CABP4P57796 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CABP4P57796 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CABP4P57796 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CABP4P57796 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CABP4P57796 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CABP4P57796 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CABP4P57796 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CABP4P57796 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CABP4P57796 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CABP4P57796 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CABP4P57796 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CABP4P57796 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CABP4P57796 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms