Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AQP4P55087 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AQP4P55087 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AQP4P55087 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AQP4P55087 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AQP4P55087 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AQP4P55087 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AQP4P55087 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AQP4P55087 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AQP4P55087 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AQP4P55087 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AQP4P55087 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AQP4P55087 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AQP4P55087 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AQP4P55087 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AQP4P55087 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AQP4P55087 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AQP4P55087 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AQP4P55087 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AQP4P55087 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AQP4P55087 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AQP4P55087 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AQP4P55087 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AQP4P55087 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AQP4P55087 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AQP4P55087 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AQP4P55087 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AQP4P55087 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AQP4P55087 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AQP4P55087 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AQP4P55087 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AQP4P55087 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AQP4P55087 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AQP4P55087 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AQP4P55087 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AQP4P55087 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AQP4P55087 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AQP4P55087 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AQP4P55087 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AQP4P55087 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AQP4P55087 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AQP4P55087 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AQP4P55087 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AQP4P55087 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AQP4P55087 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AQP4P55087 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AQP4P55087 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AQP4P55087 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AQP4P55087 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AQP4P55087 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AQP4P55087 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AQP4P55087 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AQP4P55087 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AQP4P55087 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AQP4P55087 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AQP4P55087 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
AQP4P55087 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
AQP4P55087 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
AQP4P55087 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AQP4P55087 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
AQP4P55087 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AQP4P55087 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AQP4P55087 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AQP4P55087 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
AQP4P55087 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AQP4P55087 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AQP4P55087 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AQP4P55087 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AQP4P55087 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AQP4P55087 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AQP4P55087 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AQP4P55087 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AQP4P55087 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AQP4P55087 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AQP4P55087 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AQP4P55087 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AQP4P55087 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AQP4P55087 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AQP4P55087 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AQP4P55087 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AQP4P55087 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AQP4P55087 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AQP4P55087 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AQP4P55087 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AQP4P55087 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AQP4P55087 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AQP4P55087 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AQP4P55087 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AQP4P55087 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AQP4P55087 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
AQP4P55087 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AQP4P55087 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
AQP4P55087 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
AQP4P55087 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AQP4P55087 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AQP4P55087 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AQP4P55087 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AQP4P55087 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AQP4P55087 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AQP4P55087 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms