Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP12AP54707 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms