Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRIM1P49642 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms