Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PITPNBP48739 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms