Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRXP46100 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRXP46100 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRXP46100 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRXP46100 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRXP46100 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRXP46100 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRXP46100 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRXP46100 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRXP46100 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRXP46100 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRXP46100 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRXP46100 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRXP46100 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRXP46100 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRXP46100 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRXP46100 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRXP46100 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATRXP46100 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATRXP46100 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATRXP46100 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATRXP46100 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATRXP46100 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATRXP46100 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ATRXP46100 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATRXP46100 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATRXP46100 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATRXP46100 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATRXP46100 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ATRXP46100 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATRXP46100 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATRXP46100 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATRXP46100 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATRXP46100 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATRXP46100 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATRXP46100 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ATRXP46100 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATRXP46100 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATRXP46100 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATRXP46100 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRXP46100 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRXP46100 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRXP46100 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRXP46100 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRXP46100 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRXP46100 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRXP46100 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRXP46100 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRXP46100 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRXP46100 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRXP46100 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRXP46100 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRXP46100 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRXP46100 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRXP46100 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRXP46100 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRXP46100 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRXP46100 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRXP46100 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATRXP46100 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATRXP46100 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATRXP46100 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATRXP46100 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATRXP46100 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATRXP46100 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRXP46100 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRXP46100 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRXP46100 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRXP46100 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRXP46100 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRXP46100 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRXP46100 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRXP46100 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRXP46100 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRXP46100 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRXP46100 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRXP46100 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRXP46100 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRXP46100 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRXP46100 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRXP46100 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRXP46100 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRXP46100 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRXP46100 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRXP46100 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRXP46100 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRXP46100 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRXP46100 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRXP46100 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRXP46100 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRXP46100 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRXP46100 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRXP46100 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRXP46100 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRXP46100 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRXP46100 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRXP46100 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRXP46100 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATRXP46100 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATRXP46100 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms