Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms