Protein–RNA interactions for Protein: P35499

SCN4A, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4AP35499 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN4AP35499 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms