Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXD13P35453 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD13P35453 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms