Protein–RNA interactions for Protein: P29016

CD1B, T-cell surface glycoprotein CD1b, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD1BP29016 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD1BP29016 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD1BP29016 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD1BP29016 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD1BP29016 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD1BP29016 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD1BP29016 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD1BP29016 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD1BP29016 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD1BP29016 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD1BP29016 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD1BP29016 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD1BP29016 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD1BP29016 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD1BP29016 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD1BP29016 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD1BP29016 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD1BP29016 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD1BP29016 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD1BP29016 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD1BP29016 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD1BP29016 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD1BP29016 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD1BP29016 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD1BP29016 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD1BP29016 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD1BP29016 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD1BP29016 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD1BP29016 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD1BP29016 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD1BP29016 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD1BP29016 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD1BP29016 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD1BP29016 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD1BP29016 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD1BP29016 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD1BP29016 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD1BP29016 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD1BP29016 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD1BP29016 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD1BP29016 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD1BP29016 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD1BP29016 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD1BP29016 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD1BP29016 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD1BP29016 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD1BP29016 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD1BP29016 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD1BP29016 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD1BP29016 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD1BP29016 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD1BP29016 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD1BP29016 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD1BP29016 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD1BP29016 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD1BP29016 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD1BP29016 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD1BP29016 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD1BP29016 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD1BP29016 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD1BP29016 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD1BP29016 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD1BP29016 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD1BP29016 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD1BP29016 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD1BP29016 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD1BP29016 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD1BP29016 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD1BP29016 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD1BP29016 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD1BP29016 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD1BP29016 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD1BP29016 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD1BP29016 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD1BP29016 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD1BP29016 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD1BP29016 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD1BP29016 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD1BP29016 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD1BP29016 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD1BP29016 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD1BP29016 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD1BP29016 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD1BP29016 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD1BP29016 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD1BP29016 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD1BP29016 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD1BP29016 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD1BP29016 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD1BP29016 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD1BP29016 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD1BP29016 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD1BP29016 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD1BP29016 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD1BP29016 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD1BP29016 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD1BP29016 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD1BP29016 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD1BP29016 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD1BP29016 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms