Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGB2P26583 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms