Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms