Protein–RNA interactions for Protein: P08118

MSMB, Beta-microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMBP08118 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MSMBP08118 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MSMBP08118 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MSMBP08118 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MSMBP08118 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MSMBP08118 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MSMBP08118 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MSMBP08118 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MSMBP08118 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MSMBP08118 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MSMBP08118 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MSMBP08118 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MSMBP08118 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MSMBP08118 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MSMBP08118 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MSMBP08118 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MSMBP08118 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MSMBP08118 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MSMBP08118 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MSMBP08118 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MSMBP08118 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MSMBP08118 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MSMBP08118 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MSMBP08118 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MSMBP08118 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
MSMBP08118 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MSMBP08118 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MSMBP08118 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MSMBP08118 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MSMBP08118 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MSMBP08118 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MSMBP08118 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MSMBP08118 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MSMBP08118 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MSMBP08118 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MSMBP08118 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MSMBP08118 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MSMBP08118 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MSMBP08118 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MSMBP08118 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MSMBP08118 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MSMBP08118 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MSMBP08118 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MSMBP08118 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MSMBP08118 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MSMBP08118 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MSMBP08118 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MSMBP08118 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MSMBP08118 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MSMBP08118 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MSMBP08118 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MSMBP08118 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MSMBP08118 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MSMBP08118 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MSMBP08118 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MSMBP08118 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MSMBP08118 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MSMBP08118 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSMBP08118 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSMBP08118 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSMBP08118 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSMBP08118 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSMBP08118 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSMBP08118 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSMBP08118 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSMBP08118 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSMBP08118 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSMBP08118 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSMBP08118 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSMBP08118 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSMBP08118 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSMBP08118 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSMBP08118 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSMBP08118 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MSMBP08118 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSMBP08118 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSMBP08118 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSMBP08118 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MSMBP08118 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSMBP08118 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSMBP08118 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MSMBP08118 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSMBP08118 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSMBP08118 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSMBP08118 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSMBP08118 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSMBP08118 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSMBP08118 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSMBP08118 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSMBP08118 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSMBP08118 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSMBP08118 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSMBP08118 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSMBP08118 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSMBP08118 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSMBP08118 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSMBP08118 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMBP08118 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMBP08118 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMBP08118 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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