Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDE6DO43924 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDE6DO43924 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PDE6DO43924 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PDE6DO43924 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDE6DO43924 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDE6DO43924 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDE6DO43924 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDE6DO43924 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PDE6DO43924 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDE6DO43924 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PDE6DO43924 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PDE6DO43924 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PDE6DO43924 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PDE6DO43924 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PDE6DO43924 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDE6DO43924 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDE6DO43924 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PDE6DO43924 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDE6DO43924 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PDE6DO43924 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDE6DO43924 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PDE6DO43924 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDE6DO43924 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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