Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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HOXA3O43365 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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HOXA3O43365 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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HOXA3O43365 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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