Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MEFVO15553 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MEFVO15553 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MEFVO15553 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MEFVO15553 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MEFVO15553 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MEFVO15553 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MEFVO15553 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MEFVO15553 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MEFVO15553 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MEFVO15553 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MEFVO15553 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MEFVO15553 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MEFVO15553 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MEFVO15553 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MEFVO15553 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MEFVO15553 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MEFVO15553 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MEFVO15553 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MEFVO15553 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MEFVO15553 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MEFVO15553 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MEFVO15553 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MEFVO15553 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MEFVO15553 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MEFVO15553 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MEFVO15553 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MEFVO15553 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MEFVO15553 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MEFVO15553 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MEFVO15553 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MEFVO15553 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MEFVO15553 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MEFVO15553 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MEFVO15553 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MEFVO15553 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MEFVO15553 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MEFVO15553 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MEFVO15553 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MEFVO15553 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MEFVO15553 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MEFVO15553 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MEFVO15553 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MEFVO15553 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MEFVO15553 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MEFVO15553 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MEFVO15553 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MEFVO15553 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MEFVO15553 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MEFVO15553 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MEFVO15553 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MEFVO15553 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MEFVO15553 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MEFVO15553 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MEFVO15553 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MEFVO15553 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MEFVO15553 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MEFVO15553 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MEFVO15553 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MEFVO15553 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MEFVO15553 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MEFVO15553 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MEFVO15553 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MEFVO15553 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MEFVO15553 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MEFVO15553 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MEFVO15553 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MEFVO15553 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MEFVO15553 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MEFVO15553 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MEFVO15553 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MEFVO15553 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MEFVO15553 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MEFVO15553 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MEFVO15553 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MEFVO15553 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MEFVO15553 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MEFVO15553 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MEFVO15553 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MEFVO15553 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MEFVO15553 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MEFVO15553 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MEFVO15553 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MEFVO15553 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MEFVO15553 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MEFVO15553 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MEFVO15553 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MEFVO15553 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MEFVO15553 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MEFVO15553 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MEFVO15553 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MEFVO15553 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MEFVO15553 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MEFVO15553 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MEFVO15553 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MEFVO15553 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MEFVO15553 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MEFVO15553 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MEFVO15553 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MEFVO15553 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms