Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLOCKO15516 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms