Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPRTO14522 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
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