Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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