Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL33A6NCF5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms