Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RAD54L2Q9Y4B4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RAD54L2Q9Y4B4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RAD54L2Q9Y4B4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RAD54L2Q9Y4B4 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
RAD54L2Q9Y4B4 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
RAD54L2Q9Y4B4 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
RAD54L2Q9Y4B4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC31.01■■■□□ 2.56
RAD54L2Q9Y4B4 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
RAD54L2Q9Y4B4 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
RAD54L2Q9Y4B4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
RAD54L2Q9Y4B4 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
RAD54L2Q9Y4B4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
RAD54L2Q9Y4B4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
RAD54L2Q9Y4B4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC31■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC31■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC31■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RAD54L2Q9Y4B4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms