Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PHF8Q9UPP1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PHF8Q9UPP1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms