Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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USP18Q9UMW8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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USP18Q9UMW8 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
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USP18Q9UMW8 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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