Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPUSD1Q9UJJ7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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