Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STAG3Q9UJ98 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
STAG3Q9UJ98 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STAG3Q9UJ98 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
STAG3Q9UJ98 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
STAG3Q9UJ98 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
STAG3Q9UJ98 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
STAG3Q9UJ98 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
STAG3Q9UJ98 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
STAG3Q9UJ98 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
STAG3Q9UJ98 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STAG3Q9UJ98 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STAG3Q9UJ98 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STAG3Q9UJ98 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STAG3Q9UJ98 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms