Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN11AQ9UI33 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms