Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CFDP1Q9UEE9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms