Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PHRF1Q9P1Y6 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms