Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF12Q9NZN5 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms