Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
RRP7BPQ9NSQ0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRP7BPQ9NSQ0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms