Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms