Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC31BQ9NQW1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC31BQ9NQW1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC31BQ9NQW1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC31BQ9NQW1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC31BQ9NQW1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC31BQ9NQW1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC31BQ9NQW1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC31BQ9NQW1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC31BQ9NQW1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC31BQ9NQW1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC31BQ9NQW1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC31BQ9NQW1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC31BQ9NQW1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC31BQ9NQW1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC31BQ9NQW1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC31BQ9NQW1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC31BQ9NQW1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC31BQ9NQW1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC31BQ9NQW1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC31BQ9NQW1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC31BQ9NQW1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC31BQ9NQW1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC31BQ9NQW1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms