Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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LHX9Q9NQ69 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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LHX9Q9NQ69 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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LHX9Q9NQ69 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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LHX9Q9NQ69 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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LHX9Q9NQ69 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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LHX9Q9NQ69 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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LHX9Q9NQ69 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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