Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE7BQ9NP56 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
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