Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TDRD3Q9H7E2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TDRD3Q9H7E2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms