Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C11orf49Q9H6J7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms