Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms