Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1E5

TMX4, Thioredoxin-related transmembrane protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX4Q9H1E5 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMX4Q9H1E5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms