Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms