Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CEP44Q9C0F1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms