Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRIP1Q9BX63 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms