Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWT1

CDCA7, Cell division cycle-associated protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7Q9BWT1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDCA7Q9BWT1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms