Protein–RNA interactions for Protein: Q99467

CD180, CD180 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD180Q99467 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD180Q99467 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD180Q99467 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD180Q99467 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD180Q99467 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD180Q99467 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD180Q99467 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD180Q99467 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD180Q99467 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD180Q99467 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD180Q99467 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD180Q99467 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD180Q99467 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD180Q99467 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD180Q99467 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD180Q99467 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD180Q99467 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD180Q99467 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD180Q99467 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD180Q99467 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD180Q99467 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CD180Q99467 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CD180Q99467 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CD180Q99467 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD180Q99467 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD180Q99467 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD180Q99467 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD180Q99467 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD180Q99467 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD180Q99467 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD180Q99467 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD180Q99467 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD180Q99467 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD180Q99467 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CD180Q99467 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD180Q99467 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CD180Q99467 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD180Q99467 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD180Q99467 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CD180Q99467 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD180Q99467 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD180Q99467 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CD180Q99467 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD180Q99467 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD180Q99467 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD180Q99467 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD180Q99467 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD180Q99467 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD180Q99467 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD180Q99467 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD180Q99467 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD180Q99467 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD180Q99467 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD180Q99467 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD180Q99467 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD180Q99467 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD180Q99467 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD180Q99467 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD180Q99467 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD180Q99467 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD180Q99467 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD180Q99467 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD180Q99467 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD180Q99467 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD180Q99467 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD180Q99467 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CD180Q99467 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD180Q99467 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD180Q99467 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD180Q99467 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD180Q99467 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD180Q99467 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD180Q99467 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD180Q99467 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD180Q99467 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD180Q99467 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CD180Q99467 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD180Q99467 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD180Q99467 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD180Q99467 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD180Q99467 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD180Q99467 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD180Q99467 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD180Q99467 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD180Q99467 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD180Q99467 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD180Q99467 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD180Q99467 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD180Q99467 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD180Q99467 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD180Q99467 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CD180Q99467 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD180Q99467 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD180Q99467 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD180Q99467 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD180Q99467 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD180Q99467 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD180Q99467 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD180Q99467 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD180Q99467 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms