Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 RPS26-201ENST00000356464 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 TSPAN5-202ENST00000505184 1191 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 OLA1-206ENST00000428402 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 AC099542.2-201ENST00000474149 553 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms