Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP53Q96M91 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP53Q96M91 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP53Q96M91 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP53Q96M91 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP53Q96M91 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP53Q96M91 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP53Q96M91 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP53Q96M91 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP53Q96M91 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP53Q96M91 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP53Q96M91 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP53Q96M91 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP53Q96M91 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP53Q96M91 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP53Q96M91 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP53Q96M91 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP53Q96M91 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP53Q96M91 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP53Q96M91 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP53Q96M91 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP53Q96M91 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP53Q96M91 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP53Q96M91 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP53Q96M91 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP53Q96M91 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP53Q96M91 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP53Q96M91 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP53Q96M91 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP53Q96M91 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP53Q96M91 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP53Q96M91 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP53Q96M91 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP53Q96M91 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms