Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM47Q96LD4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM47Q96LD4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms