Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED3Q96IU2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
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