Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC59Q96AG4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC59Q96AG4 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC59Q96AG4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC59Q96AG4 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC59Q96AG4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC59Q96AG4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC59Q96AG4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC59Q96AG4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC59Q96AG4 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC59Q96AG4 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC59Q96AG4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC59Q96AG4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC59Q96AG4 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC59Q96AG4 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC59Q96AG4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC59Q96AG4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms