Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC102AQ96A19 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC102AQ96A19 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms