Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-CQ95604 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms